شناسایی تعدادی از ژنهای سیکلوتیدی از گیاه بنفشه سه رنگ (viola tricolor) بومی ایران و مطالعه ی فعالیت ضدمیکروبی آنها

سیکلوتیدها خانواده بزرگی از پپتیدهای گیاهی هستند که در خانواده های گیاهی violaceae، rubiaceae ، cucurbitaceae و fabaceae بیان می شوند. ساختار این پپتیدهای کوچک به طور متوسط از 30 اسیدآمینه تشکیل شده و شامل موتیف گره سیستینی حلقوی (cck) می باشد. باور بر اینست که سیکلوتیدها به واسطه اثرات حشره کشی، نقش مهمی در سیستم دفاعی گیاهان ایفا می کنند. سیکلوتیدها به دلیل فعالیت های زیستی متعدد از جمله ضد ویروس، ضد قارچ، ضد باکتری، ضد کرم، ضد آفات، ضد سرطان و... و نیز ساختار منحصر به فرد خود مورد علاقه ی محققین برای مهندسی پروتئین به منظور کاربردهای دارویی و کشاورزی می باشند. این پپتیدهای حلقوی محصولات ژنی طبیعی بوده و سنتز ریبوزومی دارند. از این رو مطالعه و توالی یابی ساختارهای ژنتیکی این پپتیدها حائز اهمیت است. در این مطالعه شناسایی ژن های سیکلوتیدی از گیاه بنفشه سه رنگ (viola tricolor)، با استفاده از غربالگری cdna و همسانه سازی قطعات به دست آمده، صورت گرفته است. نتایج حاصل از این بخش، شناسایی پیش ساز ژنی سیکلوتیدی جدیدی را در پی داشت که تاکنون شناخته نشده بود. استخراج و خالص سازی نسبی سیکلوتیدها از گیاه مورد مطالعه نیز با استفاده از روش solid phase extraction انجام شده و با روش های برادفورد و tricine-sds page بررسی و تایید گردید. اثرات ضد میکروبی عصاره های تام و سیکلوتیدهای خالص شده نیز به روش انتشار شعاعی از چاهک روی سویه های استاندارد بیماری زا مورد بررسی قرار گرفت و بیشترین تاثیر روی باکتری های گرم منفی مشاهده شد.